Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLVAPQ9BX97 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms