Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms