Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms