Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms