Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms