Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms