Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms