Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms