Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms