Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms