Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRIQ1Q96JM4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRIQ1Q96JM4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRIQ1Q96JM4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRIQ1Q96JM4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
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