Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms