Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms