Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms