Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms