Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP2Q8IXW5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms