Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms