Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FGD6Q6ZV73 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD6Q6ZV73 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms