Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms