Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms