Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms