Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms