Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms