Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCID2Q5JVF3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms