Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms