Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms