Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC92Q53HC0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms