Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms