Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCGF3Q3KNV8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms