Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBPF1Q3BBV0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms