Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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GEN1Q17RS7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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GEN1Q17RS7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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GEN1Q17RS7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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GEN1Q17RS7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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GEN1Q17RS7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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