Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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RTL8BQ17RB0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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RTL8BQ17RB0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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RTL8BQ17RB0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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RTL8BQ17RB0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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RTL8BQ17RB0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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RTL8BQ17RB0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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RTL8BQ17RB0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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RTL8BQ17RB0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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RTL8BQ17RB0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
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