Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NKX1-1Q15270 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
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