Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
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EEA1Q15075 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
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EEA1Q15075 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
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EEA1Q15075 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
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EEA1Q15075 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EEA1Q15075 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
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