Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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GBX1Q14549 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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GBX1Q14549 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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GBX1Q14549 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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GBX1Q14549 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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GBX1Q14549 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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GBX1Q14549 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
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GBX1Q14549 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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