Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms