Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
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FAM53BQ14153 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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FAM53BQ14153 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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