Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBFBQ13951 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms