Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
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SHROOM2Q13796 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
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SHROOM2Q13796 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
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SHROOM2Q13796 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHROOM2Q13796 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
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SHROOM2Q13796 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
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SHROOM2Q13796 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
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SHROOM2Q13796 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
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