Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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