Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNW1Q13573 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNW1Q13573 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms