Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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