Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms