Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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