Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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PTP4A2Q12974 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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PTP4A2Q12974 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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