Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms