Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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FOXF2Q12947 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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