Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNH2Q12809 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNH2Q12809 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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