Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms