Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms